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特征工程-知识汇总
阅读量:5820 次
发布时间:2019-06-18

本文共 8608 字,大约阅读时间需要 28 分钟。

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1 特征工程是什么?

2 数据预处理
  2.1 无量纲化
    2.1.1 标准化
    2.1.2 区间缩放法
    2.1.3 标准化与归一化的区别
  2.2 对定量特征二值化
  2.3 对定性特征哑编码
  2.4 缺失值计算
  2.5 数据变换
  2.6 回顾
3 特征选择
  3.1 Filter
    3.1.1 方差选择法
    3.1.2 相关系数法
    3.1.3 卡方检验
    3.1.4 互信息法
  3.2 Wrapper
    3.2.1 递归特征消除法
  3.3 Embedded
    3.3.1 基于惩罚项的特征选择法
    3.3.2 基于树模型的特征选择法
  3.4 回顾
4 降维
  4.1 主成分分析法(PCA)
  4.2 线性判别分析法(LDA)
  4.3 回顾
5 总结
6 参考资料

1 特征工程是什么?

  有这么一句话在业界广泛流传:数据和特征决定了机器学习的上限,而模型和算法只是逼近这个上限而已。那特征工程到底是什么呢?顾名思义,其本质是一项工程活动,目的是最大限度地从原始数据中提取特征以供算法和模型使用。通过总结和归纳,人们认为特征工程包括以下方面:

  特征处理是特征工程的核心部分,sklearn提供了较为完整的特征处理方法,包括数据预处理,特征选择,降维等。首次接触到sklearn,通常会被其丰富且方便的算法模型库吸引,但是这里介绍的特征处理库也十分强大!

  本文中使用sklearn中的来对特征处理功能进行说明。IRIS数据集由Fisher在1936年整理,包含4个特征(Sepal.Length(花萼长度)、Sepal.Width(花萼宽度)、Petal.Length(花瓣长度)、Petal.Width(花瓣宽度)),特征值都为正浮点数,单位为厘米。目标值为鸢尾花的分类(Iris Setosa(山鸢尾)、Iris Versicolour(杂色鸢尾),Iris Virginica(维吉尼亚鸢尾))。导入IRIS数据集的代码如下:

复制代码

1 from sklearn.datasets import load_iris 2  3 #导入IRIS数据集 4 iris = load_iris() 5  6 #特征矩阵 7 iris.data 8  9 #目标向量10 iris.target

复制代码

2 数据预处理

  通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

  • 不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。
  • 信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。
  • 定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。:假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。
  • 存在缺失值:缺失值需要补充。
  • 信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

  我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,可以覆盖以上问题的解决方案。

2.1 无量纲化

  无量纲化使不同规格的数据转换到同一规格。常见的无量纲化方法有标准化和区间缩放法。标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。

2.1.1 标准化

  标准化需要计算特征的均值和标准差,公式表达为:

  使用preproccessing库的StandardScaler类对数据进行标准化的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import StandardScaler2 3 #标准化,返回值为标准化后的数据4 StandardScaler().fit_transform(iris.data)

2.1.2 区间缩放法

  区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,公式表达为:

  使用preproccessing库的MinMaxScaler类对数据进行区间缩放的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler2 3 #区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据4 MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)

2.1.3 标准化与归一化的区别

  简单来说,标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。归一化是依照特征矩阵的行处理数据,其目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准,也就是说都转化为“单位向量”。规则为l2的归一化公式如下:

  使用preproccessing库的Normalizer类对数据进行归一化的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import Normalizer2 3 #归一化,返回值为归一化后的数据4 Normalizer().fit_transform(iris.data)

2.2 对定量特征二值化

  定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

  使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import Binarizer2 3 #二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据4 Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)

2.3 对定性特征哑编码

  由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行哑编码(实际上是不需要的)。使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行哑编码的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder2 3 #哑编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为哑编码后的数据4 OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape((-1,1)))

2.4 缺失值计算

  由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。使用preproccessing库的Imputer类对数据进行缺失值计算的代码如下:

复制代码

1 from numpy import vstack, array, nan2 from sklearn.preprocessing import Imputer3 4 #缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据5 #参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN6 #参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)7 Imputer().fit_transform(vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)))

复制代码

2.5 数据变换

  常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。4个特征,度为2的多项式转换公式如下:

  使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换的代码如下:

1 from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures2 3 #多项式转换4 #参数degree为度,默认值为25 PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)

  基于单变元函数的数据变换可以使用一个统一的方式完成,使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换的代码如下:

1 from numpy import log1p2 from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer3 4 #自定义转换函数为对数函数的数据变换5 #第一个参数是单变元函数6 FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)

2.6 回顾

功能 说明
StandardScaler 无量纲化 标准化,基于特征矩阵的列,将特征值转换至服从标准正态分布
MinMaxScaler 无量纲化 区间缩放,基于最大最小值,将特征值转换到[0, 1]区间上
Normalizer 归一化 基于特征矩阵的行,将样本向量转换为“单位向量”
Binarizer 二值化 基于给定阈值,将定量特征按阈值划分
OneHotEncoder 哑编码 将定性数据编码为定量数据
Imputer 缺失值计算 计算缺失值,缺失值可填充为均值等
PolynomialFeatures 多项式数据转换 多项式数据转换
FunctionTransformer 自定义单元数据转换 使用单变元的函数来转换数据

 

 

3 特征选择

  当数据预处理完成后,我们需要选择有意义的特征输入机器学习的算法和模型进行训练。通常来说,从两个方面考虑来选择特征:

  • 特征是否发散:如果一个特征不发散,例如方差接近于0,也就是说样本在这个特征上基本上没有差异,这个特征对于样本的区分并没有什么用。
  • 特征与目标的相关性:这点比较显见,与目标相关性高的特征,应当优选选择。除方差法外,本文介绍的其他方法均从相关性考虑。

  根据特征选择的形式又可以将特征选择方法分为3种:

  • Filter:过滤法,按照发散性或者相关性对各个特征进行评分,设定阈值或者待选择阈值的个数,选择特征。
  • Wrapper:包装法,根据目标函数(通常是预测效果评分),每次选择若干特征,或者排除若干特征。
  • Embedded:嵌入法,先使用某些机器学习的算法和模型进行训练,得到各个特征的权值系数,根据系数从大到小选择特征。类似于Filter方法,但是是通过训练来确定特征的优劣。

  我们使用sklearn中的feature_selection库来进行特征选择。

3.1 Filter

3.1.1 方差选择法

  使用方差选择法,先要计算各个特征的方差,然后根据阈值,选择方差大于阈值的特征。使用feature_selection库的VarianceThreshold类来选择特征的代码如下:

1 from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold2 3 #方差选择法,返回值为特征选择后的数据4 #参数threshold为方差的阈值5 VarianceThreshold(threshold=3).fit_transform(iris.data)

3.1.2 相关系数法

  使用相关系数法,先要计算各个特征对目标值的相关系数以及相关系数的P值。用feature_selection库的SelectKBest类结合相关系数来选择特征的代码如下:

复制代码

1 from sklearn.feature_selection import SelectKBest2 from scipy.stats import pearsonr3 4 #选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据5 #第一个参数为计算评估特征是否好的函数,该函数输入特征矩阵和目标向量,输出二元组(评分,P值)的数组,数组第i项为第i个特征的评分和P值。在此定义为计算相关系数6 #参数k为选择的特征个数7 SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:pearsonr(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)

复制代码

3.1.3 卡方检验

  经典的卡方检验是检验定性自变量对定性因变量的相关性。假设自变量有N种取值,因变量有M种取值,考虑自变量等于i且因变量等于j的样本频数的观察值与期望的差距,构建统计量:

  。用feature_selection库的SelectKBest类结合卡方检验来选择特征的代码如下:

1 from sklearn.feature_selection import SelectKBest2 from sklearn.feature_selection import chi23 4 #选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据5 SelectKBest(chi2, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)

3.1.4 互信息法

  经典的互信息也是评价定性自变量对定性因变量的相关性的,互信息计算公式如下:

  为了处理定量数据,最大信息系数法被提出,使用feature_selection库的SelectKBest类结合最大信息系数法来选择特征的代码如下:

复制代码

1 from sklearn.feature_selection import SelectKBest 2 from minepy import MINE 3  4 #由于MINE的设计不是函数式的,定义mic方法将其为函数式的,返回一个二元组,二元组的第2项设置成固定的P值0.5 5 def mic(x, y): 6     m = MINE() 7     m.compute_score(x, y) 8     return (m.mic(), 0.5) 9 10 #选择K个最好的特征,返回特征选择后的数据11 SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:mic(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)

复制代码

3.2 Wrapper

3.2.1 递归特征消除法

  递归消除特征法使用一个基模型来进行多轮训练,每轮训练后,消除若干权值系数的特征,再基于新的特征集进行下一轮训练。使用feature_selection库的RFE类来选择特征的代码如下:

复制代码

1 from sklearn.feature_selection import RFE2 from sklearn.linear_model import LogisticRegression3 4 #递归特征消除法,返回特征选择后的数据5 #参数estimator为基模型6 #参数n_features_to_select为选择的特征个数7 RFE(estimator=LogisticRegression(), n_features_to_select=2).fit_transform(iris.data, iris.target)

复制代码

3.3 Embedded

3.3.1 基于惩罚项的特征选择法

  使用带惩罚项的基模型,除了筛选出特征外,同时也进行了降维。使用feature_selection库的SelectFromModel类结合带L1惩罚项的逻辑回归模型,来选择特征的代码如下:

1 from sklearn.feature_selection import SelectFromModel2 from sklearn.linear_model import LogisticRegression3 4 #带L1惩罚项的逻辑回归作为基模型的特征选择5 SelectFromModel(LogisticRegression(penalty="l1", C=0.1)).fit_transform(iris.data, iris.target)

  ,所以没选到的特征不代表不重要。故,可结合L2惩罚项来优化。具体操作为:若一个特征在L1中的权值为1,选择在L2中权值差别不大且在L1中权值为0的特征构成同类集合,将这一集合中的特征平分L1中的权值,故需要构建一个新的逻辑回归模型:

 View Code

  使用feature_selection库的SelectFromModel类结合带L1以及L2惩罚项的逻辑回归模型,来选择特征的代码如下:

1 from sklearn.feature_selection import SelectFromModel2 3 #带L1和L2惩罚项的逻辑回归作为基模型的特征选择4 #参数threshold为权值系数之差的阈值5 SelectFromModel(LR(threshold=0.5, C=0.1)).fit_transform(iris.data, iris.target)

3.3.2 基于树模型的特征选择法

  树模型中GBDT也可用来作为基模型进行特征选择,使用feature_selection库的SelectFromModel类结合GBDT模型,来选择特征的代码如下:

1 from sklearn.feature_selection import SelectFromModel2 from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier3 4 #GBDT作为基模型的特征选择5 SelectFromModel(GradientBoostingClassifier()).fit_transform(iris.data, iris.target)

3.4 回顾

所属方式 说明
VarianceThreshold Filter 方差选择法
SelectKBest Filter 可选关联系数、卡方校验、最大信息系数作为得分计算的方法
RFE Wrapper 递归地训练基模型,将权值系数较小的特征从特征集合中消除
SelectFromModel Embedded 训练基模型,选择权值系数较高的特征

 

4 降维

  当特征选择完成后,可以直接训练模型了,但是可能由于特征矩阵过大,导致计算量大,训练时间长的问题,因此降低特征矩阵维度也是必不可少的。常见的降维方法除了以上提到的基于L1惩罚项的模型以外,另外还有主成分分析法(PCA)和线性判别分析(LDA),线性判别分析本身也是一个分类模型。PCA和LDA有很多的相似点,其本质是要将原始的样本映射到维度更低的样本空间中,但是PCA和LDA的映射目标不一样:。所以说PCA是一种无监督的降维方法,而LDA是一种有监督的降维方法。

4.1 主成分分析法(PCA)

  使用decomposition库的PCA类选择特征的代码如下:

1 from sklearn.decomposition import PCA2 3 #主成分分析法,返回降维后的数据4 #参数n_components为主成分数目5 PCA(n_components=2).fit_transform(iris.data)

4.2 线性判别分析法(LDA)

  使用lda库的LDA类选择特征的代码如下:

1 from sklearn.lda import LDA2 3 #线性判别分析法,返回降维后的数据4 #参数n_components为降维后的维数5 LDA(n_components=2).fit_transform(iris.data, iris.target)

4.3 回顾

说明
decomposition PCA 主成分分析法
lda LDA 线性判别分析法

 

5 总结

  再让我们回归一下本文开始的特征工程的思维导图,我们可以使用sklearn完成几乎所有特征处理的工作,而且不管是数据预处理,还是特征选择,抑或降维,它们都是通过某个类的方法fit_transform完成的,fit_transform要不只带一个参数:特征矩阵,要不带两个参数:特征矩阵加目标向量。这些难道都是巧合吗?还是故意设计成这样?方法fit_transform中有fit这一单词,它和训练模型的fit方法有关联吗?接下来,我将在中阐述其中的奥妙!

6 参考资料

转载于:https://my.oschina.net/tantexian/blog/1924179

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